Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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