Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms