Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl1Q99N96 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl1Q99N96 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms