Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprtQ99M80 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms