Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms