Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms