Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms