Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms