Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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