Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm43Q99J64 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms