Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan1Q99J59 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms