Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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