Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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