Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms