Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spdl1Q923A2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms