Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cabp4Q8VHC5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cabp4Q8VHC5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms