Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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