Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms