Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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