Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms