Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms