Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms