Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms