Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms