Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scara5Q8K299 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scara5Q8K299 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scara5Q8K299 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms