Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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