Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim68Q8K243 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim68Q8K243 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trim68Q8K243 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trim68Q8K243 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim68Q8K243 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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