Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms