Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms