Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms