Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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