Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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