Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp20Q8C6M1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms