Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms