Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms