Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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