Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cep55Q8BT07 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep55Q8BT07 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms