Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik4Q8BMF5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms