Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hirip3Q8BLH7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hirip3Q8BLH7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms