Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Liat1Q810M6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms