Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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