Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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