Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Npm2Q80W85 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Npm2Q80W85 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms