Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms