Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnphQ80U23 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnphQ80U23 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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