Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NischQ80TM9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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NischQ80TM9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NischQ80TM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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NischQ80TM9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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