Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms