Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms