Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms