Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sys1Q78S06 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms